Do zadań Centralnego Azylu należy:
1) transport i czasowe przetrzymywanie okazów gatunków zwierząt, o których mowa w art. 3 ust. 1, przekazanych przez organy celne lub organy Policji;
2) czasowe przetrzymywanie okazów gatunków zwierząt, o których mowa w art. 3 ust. 1, przekazanych przez organy administracji publicznej, podmioty i jednostki inne niż wymienione w pkt 1, po uzyskaniu zgody Dyrektora Centralnego Azylu;
3) czasowe przetrzymywanie okazów gatunków zwierząt, o których mowa w art. 3 ust. 2, przekazanych przez organy celne, organy Policji lub organy administracji publicznej, po uzyskaniu zgody Dyrektora Centralnego Azylu;
3a) transport okazów gatunków zwierząt, o których mowa w pkt 2 i 3, po uzyskaniu zgody Dyrektora Centralnego Azylu;
4) poddawanie zwierząt przyjętych do Centralnego Azylu kwarantannie lub izolacji;
5) znakowanie zwierząt przyjętych do Centralnego Azylu, wobec których nie dopełniono takiego obowiązku;
6) wprowadzanie do środowiska przyrodniczego zwierząt przetrzymywanych w Centralnym Azylu;
7) przekazywanie zwierząt przetrzymywanych w Centralnym Azylu innym podmiotom publicznym i prywatnym w kraju i za granicą;
8) humanitarne traktowanie zwierząt przetrzymywanych w Centralnym Azylu;
9) ochrona przyrody i edukacja w zakresie działalności Centralnego Azylu.

Art. 4a. Zadania Centralnego Azylu, o których mowa w art. 4 pkt 1–5, mogą być wykonywane przez inne podmioty na podstawie porozumień lub umów określających zakres zadań planowanych do wykonania, jeżeli przemawiają za tym względy ekonomiczne lub organizacyjne.

Art. 4b. W przypadku gdy wykonanie zadania, o którym mowa w art. 4 pkt 1, nie jest możliwe ze względu na:
1) brak możliwości zapewnienia w Centralnym Azylu właściwych warunków do przetrzymywania zwierząt i opieki nad nimi, odpowiadających ich potrzebom biologicznym oraz mających wpływ na ich zdrowie i dobrostan,
2) bieżące obłożenie Centralnego Azylu uniemożliwiające zachowanie jego przepustowości i operacyjności,
3) ryzyko przekroczenia limitu wydatków, o którym mowa w art. 36 ust. 1
– Centralny Azyl podejmuje czynności zmierzające do umieszczenia zwierzęcia w ogrodzie zoologicznym, ośrodku rehabilitacji zwierząt lub azylu dla zwierząt.