W celu zapewnienia bezpieczeństwa przetwarzania danych PNR, KSI PNR:
1) zapobiega dostępowi osób nieuprawnionych do KSI PNR;
2) zapobiega nieuprawnionemu przetwarzaniu danych PNR;
3) zapewnia rejestrowanie wszystkich przypadków, w których uzyskano dostęp do danych PNR lub wykorzystano je w inny sposób przez KSI PNR.