Organizację przygotowania systemu kierowania realizuje się w szczególności przez:
1) zachowanie ciągłości podejmowania i przekazywania decyzji;
2) monitorowanie źródeł, rodzajów, kierunków i skali zagrożeń;
3) reagowanie na powstałe zagrożenia bezpieczeństwa państwa na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej oraz poza jej granicami;
4) minimalizowanie i usuwanie skutków zagrożeń bezpieczeństwa państwa;
5) monitorowanie i uzupełnianie zasobów obronnych państwa.