1. Agencja prowadzi samodzielną gospodarkę finansową na podstawie rocznego planu finansowego, o którym mowa w ustawie z dnia 27 sierpnia 2009 r. o finansach publicznych. 2. Roczny plan finansowy Agencji zawiera informacje o:
1) przychodach, w tym dotacjach, o których mowa w art. 28 ust. 1 pkt 1–2, oraz odpisie wymienionym w art. 28 ust. 1 pkt 3;
2) kosztach, w tym wynagrodzeniach pracowników Agencji, jej organów oraz ekspertów, o których mowa w art. 18 ust. 1 i 3, i składkach od nich naliczanych;
3) płatnościach odsetkowych wynikających z zaciągniętych zobowiązań;
4) zakupach towarów i usług;
5) środkach na wydatki majątkowe;
6) środkach przyznanych innym podmiotom;
7) stanie należności i zobowiązań na początek i koniec roku;
8) stanie środków pieniężnych na początek i koniec roku. 3. Rokiem obrotowym Agencji jest rok kalendarzowy. 4. Projekt rocznego planu finansowego Agencji, po zaopiniowaniu przez Radę i uzgodnieniu z ministrem właściwym do spraw finansów publicznych, jest zatwierdzany przez ministra właściwego do spraw zdrowia i przekazywany ministrowi właściwemu do spraw finansów publicznych w trybie i terminie określonych w przepisach dotyczących prac nad projektem ustawy budżetowej. 5. Do dnia zatwierdzenia rocznego planu finansowego Agencja działa na podstawie projektu tego planu. 6. Prezes, w terminie do dnia 30 kwietnia, przedstawia ministrowi właściwemu do spraw zdrowia następujące dokumenty dotyczące poprzedniego roku obrotowego:
1) roczne sprawozdanie finansowe Agencji wraz ze sprawozdaniem z badania, o którym mowa w art. 32 ust. 1;
2) roczne sprawozdanie z działalności Agencji;
3) opinie Rady dotyczące sprawozdań, o których mowa w pkt 1 i 2. 7. Dokumenty, o których mowa w ust. 6, podlegają publikacji na stronie podmiotowej Biuletynu Informacji Publicznej Agencji oraz na stronie internetowej Agencji.