Szczegółowymi kryteriami wynagradzania pracowników Biura Narodowego Centrum Badań i Rozwoju są:
1) wykształcenie i jego przydatność dla realizacji zadań na stanowisku pracy;
2) znajomość języków obcych i jej przydatność dla realizacji zadań na stanowisku pracy;
3) doświadczenie zawodowe i jego przydatność dla realizacji zadań na stanowisku pracy;
4) dodatkowe kwalifikacje zawodowe i ich przydatność dla realizacji zadań na stanowisku pracy;
5) kompetencje społeczne i ich przydatność dla realizacji zadań na stanowisku pracy;
6) zakres odpowiedzialności za realizację przez współpracowników lub podległych pracowników zadań na stanowisku pracy;
7) poziom samodzielności wymaganej do realizacji zadań na stanowisku pracy;
8) poziom kreatywności wymaganej do realizacji zadań na stanowisku pracy;
9) poziom złożoności zadań realizowanych na stanowisku pracy;
10) dodatkowe zadania realizowane na stanowisku pracy;
11) zakres wpływu na decyzje związane z realizacją zadań na stanowisku pracy;
12) zakres wpływu na osiąganie celów Narodowego Centrum Badań i Rozwoju;
13) poziom narażenia na czynniki utrudniające realizację zadań na stanowisku pracy;
14) jakość pracy i zaangażowanie w realizację zadań na stanowisku pracy;
15) konieczność wykonywania pracy poza granicami Rzeczypospolitej Polskiej;
16) uwarunkowania rynku pracy w zakresie wynagradzania za realizację zadań na stanowisku pracy.