Środki Funduszu przeznacza się na finansowanie zadań Funduszu, w szczególności w zakresie:
1) gwarantowania środków pieniężnych;
2) przymusowej restrukturyzacji;
2a) restrukturyzacji i uporządkowanej likwidacji CCP;
3) działalności pomocowej dla banków na cele określone w art. 35 ust. 3 i 4 ustawy o funkcjonowaniu banków spółdzielczych;
4) nabycia praw majątkowych, o których mowa w art. 314;
4a) restrukturyzacji banków i kas;
5) pokrywania kosztów lub nakładów związanych z działalnością Funduszu.